Trong bài viết này, chúng ta sẽ thấy cách cắt một dendrogram phân cấp thành các cụm thông qua một giá trị ngưỡng bằng cách sử dụng SCIPY trong Python. Show Dendrogram là một loại sơ đồ cây cho thấy phân cụm phân cấp, tức là mối quan hệ giữa các bộ dữ liệu tương tự. Nó được sử dụng để phân tích mối quan hệ phân cấp giữa các lớp khác nhau. Gói Scipy.Cluster trang bị cho chúng tôi các công cụ cần thiết để phân cụm phân cấp và vẽ đồ thị. Vì vậy, phải được nhập khẩu vào môi trường.scipy.cluster package equips us with tools needed for hierarchical clustering and dendrogram plotting. Thus, has to be imported into the environment. Trước tiên chúng ta hãy tạo một số dữ liệu mẫu và vẽ nó bình thường. Chúng tôi đã lấy một loạt các điểm dữ liệu ngẫu nhiên làm đầu vào của chúng tôi, chúng tôi sẽ vẽ đồ thị của họ sau đó. Ví dụ: Chương trình mẫu để tạo và trực quan hóa dữ liệu Sample program for creating and visualizing data Python3
Output:  Các điểm dữ liệu đầu vào mẫu Dendrogram có thể được vẽ dễ dàng bằng cách sử dụng ma trận liên kết. Một ma trận liên kết được tạo thông qua hàm linkage (). Ma trận này chứa mã hóa phân cụm phân cấp để kết xuất dưới dạng dendrogram.
Ví dụ: Tạo một dendrogram cho dữ liệu của chúng tôi Creating a Dendrogram for our data Python3
Output: Dendrogram ban đầu mà không có bất kỳ sự giới hạn nào Bây giờ, hãy để Lừa cắt Dendrogram bằng một giá trị ngưỡng. Chúng tôi đã chọn giá trị cắt hoặc ngưỡng là 4. Ở giá trị này, một đường thẳng đứng cũng có thể được rút ra. & NBSP; Đối với giá trị cắt/ngưỡng được chọn, chúng ta luôn có thể chỉ cần đếm số lượng giao điểm với các đường thẳng đứng của dendrogram để có được số lượng cụm được hình thành. Giả sử chúng tôi chọn cắt MAX_D = 6, chúng tôi sẽ nhận được 2 cụm cuối cùng. Ví dụ: Cắt dendrogram ở giá trị ngưỡng Cutting dendrogram at the threshold value Python3
Dendrogram ban đầu mà không có bất kỳ sự giới hạn nào Output: Bây giờ, hãy để Lừa cắt Dendrogram bằng một giá trị ngưỡng. Chúng tôi đã chọn giá trị cắt hoặc ngưỡng là 4. Ở giá trị này, một đường thẳng đứng cũng có thể được rút ra. & NBSP; Bạn cắt trong một dendrogram ở đâu?Thực tiễn phổ biến đối với các dendrogram trong các cụm K là cắt chúng ở độ cao không đổi k 1.constant height k−1.
Chúng ta có thể cắt tỉa dendrogram không?Dendrogram lớn có thể được cắt tỉa trong hộp cắt tỉa bằng cách chọn độ sâu tối đa của dendrogram.Điều này chỉ ảnh hưởng đến màn hình, không phải phân cụm thực tế.Tiện ích cung cấp ba phương thức lựa chọn khác nhau: Hướng dẫn sử dụng (nhấp vào bên trong dendrogram sẽ chọn một cụm.. This only affects the display, not the actual clustering. The widget offers three different selection methods: Manual (Clicking inside the dendrogram will select a cluster.
Làm cách nào để tạo ra một dendrogram trong Python?Dendrograms trong Python.. Dendrogram cơ bản.Một dendrogram là một sơ đồ đại diện cho một cây.Nhà máy hình có tên created_dendrogram thực hiện phân cụm phân cấp trên dữ liệu và biểu thị cây kết quả..... Đặt ngưỡng màu .. Đặt định hướng và thêm nhãn .. Vẽ một dendrogram với một bản đồ nhiệt.Xem thêm Bản demo Bio Dash .. |
