Làm thế nào để bạn mở biopython?

BioPython là gói các công cụ có sẵn miễn phí để tính toán sinh học được viết bằng ngôn ngữ lập trình Python. BioPython có nhiều mô-đun khác nhau cho phép bạn thực hiện các tác vụ khác nhau trên dữ liệu sinh học của mình. Do đó, bằng cách sử dụng các mô-đun có sẵn trong gói BioPython, bạn sẽ không cần viết các dòng mã dài để thực hiện một tác vụ cụ thể trên dữ liệu sinh học của mình thay vào đó, bạn chỉ cần gọi các hàm tích hợp có sẵn trong BioPython và thực hiện các tác vụ đó

Cài đặt BioPython

Để cài đặt gói BioPython, bạn cần thực hiện các bước sau

Bước 1. Mở CMD (dấu nhắc lệnh) trên windows hoặc terminal đối với hệ điều hành macOS hoặc Linux.

Bước 2. Viết lệnh. pip cài đặt biopython và nhấn enter để gọi hàm pip.

Làm thế nào để bạn mở biopython?

Bước 3. Để xác minh xem gói BioPython đã được cài đặt thành công hay chưa, hãy mở chương trình IDLE là trình thông dịch tích hợp sẵn trong ngôn ngữ lập trình Python.

Bước 4. Nhập lệnh. từ sinh học. seq nhập seq và chạy nó.

Bước 5. Nếu không có lỗi sau khi chạy lệnh có nghĩa là BioPython đã được cài đặt thành công và sẵn sàng hoạt động.

Bước 6. Mở Visual Code hoặc Jupyter Notebook và viết lệnh. sinh học. seq nhập seq và thực hiện nó.

Làm thế nào để bạn mở biopython?

Bước 7 . Nếu nó không hiển thị lỗi khi thực thi, điều đó có nghĩa là mô-đun của bạn đã sẵn sàng và bạn có thể bắt đầu làm việc với nó.

Nếu bạn gặp lỗi "ModuleNotFoundError. Không có mô-đun nào có tên 'Bio' trong Python", hãy xem bài viết khác của tôi

Nếu bạn gặp lỗi "'pip' không được nhận dạng là lệnh nội bộ hoặc lệnh bên ngoài", hãy sử dụng lệnh

Set-ExecutionPolicy RemoteSigned -Scope CurrentUser
1 khi cài đặt biopython

python -m pip install biopython

python3 -m pip install biopython

py -m pip install biopython

Ngoài ra, bạn có thể cài đặt mô-đun biopython trong môi trường ảo

  1. Mở thư mục gốc của dự án của bạn
  2. Nhấn
    Set-ExecutionPolicy RemoteSigned -Scope CurrentUser
    
    4 và nhấp chuột phải vào Explorer

Làm thế nào để bạn mở biopython?

  1. Nhấp vào "Mở cửa sổ PowerShell tại đây"
  2. Chạy các lệnh sau

Nếu lệnh

Set-ExecutionPolicy RemoteSigned -Scope CurrentUser
5 không hoạt động, hãy thử 2 lệnh sau

  • Set-ExecutionPolicy RemoteSigned -Scope CurrentUser
    
    6
  • Set-ExecutionPolicy RemoteSigned -Scope CurrentUser
    
    7

Nếu bạn thấy thông báo lỗi "không thể tải ps1 vì chạy tập lệnh bị tắt trên hệ thống này", hãy chạy lệnh sau, nhập "có" khi được nhắc và chạy lại lệnh kích hoạt

Set-ExecutionPolicy RemoteSigned -Scope CurrentUser

Bạn có thể xác minh rằng mô-đun biopython đã được cài đặt bằng cách sử dụng lệnh

Set-ExecutionPolicy RemoteSigned -Scope CurrentUser
9

________số 8_______

Lệnh

Set-ExecutionPolicy RemoteSigned -Scope CurrentUser
9 sẽ cho biết gói chưa được cài đặt hoặc hiển thị một loạt thông tin về gói, bao gồm cả vị trí cài đặt gói

Cài đặt biopython trên macOS hoặc Linux

Để cài đặt biopython trên macOS hoặc Linux

  1. Tìm kiếm "thiết bị đầu cuối" và khởi động ứng dụng
  2. Nhập
    Set-ExecutionPolicy RemoteSigned -Scope CurrentUser
    
    0 và nhấn Enter

Làm thế nào để bạn mở biopython?

Làm thế nào để bạn mở biopython?

Nếu bạn gặp lỗi không tìm thấy

pip show biopython
pip3 show biopython

python -m pip show biopython
python3 -m pip show biopython
2, hãy sử dụng lệnh
Set-ExecutionPolicy RemoteSigned -Scope CurrentUser
1

python -m pip install biopython

python3 -m pip install biopython

Nếu bạn gặp lỗi về quyền, e. g. "[WinError. 5] Truy cập bị từ chối", thêm tùy chọn

pip show biopython
pip3 show biopython

python -m pip show biopython
python3 -m pip show biopython
3 vào lệnh cài đặt

Làm cách nào để cài đặt Biopython trong Pip?

Hướng dẫn cài đặt .
pip cài đặt biopython
pip cài đặt biopython --upgrade
gỡ cài đặt pip biopython
python -m ensurepip
trăn3. 9 -m pip cài đặt biopython pypy -m pip cài đặt biopython
C. \Python39\Scripts\pip cài đặt biopython
xcode-select --install
thiết lập trăn. py xây dựng thiết lập python. py kiểm tra thiết lập python. cài đặt py

Làm cách nào để cài đặt Biopython trong vscode?

Cài đặt rất dễ dàng và không mất quá năm phút. .
Bước 1 - Xác minh cài đặt Python
Bước 2 - Cài đặt Biopython bằng pip
Bước 3 - Xác minh cài đặt Biopython
Cách thay thế - Cài đặt Biopython bằng Nguồn

Thư viện Biopython là gì?

Biopython là giao diện lập trình ứng dụng (API) nguồn mở lớn được sử dụng trong cả phát triển phần mềm tin sinh học và trong các tập lệnh hàng ngày cho các tác vụ tin sinh học thông thường . Trang chủ www. trăn sinh học. org cung cấp quyền truy cập vào mã nguồn, tài liệu và danh sách gửi thư.

Biopython có phải là một mô-đun không?

Về cơ bản, Biopython là tập hợp các mô-đun python cung cấp các chức năng xử lý các hoạt động của chuỗi DNA, RNA & protein chẳng hạn như bổ sung ngược của .