Khóa học trực tuyến Python cho tin sinh học

Khóa học này cung cấp phần giới thiệu thực tế về cách viết chương trình Python cho người mới hoàn thành. Những người tham gia được hướng dẫn thông qua các khái niệm cốt lõi của Python bao gồm cú pháp Python, cấu trúc dữ liệu và đọc/ghi tệp. Chúng được minh họa bằng một loạt các chương trình ví dụ. Sau khi hoàn thành khóa học, học viên sẽ có thể viết các chương trình Python đơn giản

Xin lưu ý rằng nếu bạn không đủ điều kiện đăng ký tài khoản Raven của Đại học Cambridge, bạn sẽ cần đặt trước hoặc đăng ký sở thích của mình bằng cách liên kết tại đây

• Sinh viên sau đại học, Postdocs và nhân viên từ Đại học Cambridge, các tổ chức liên kết và các tổ chức hoặc cá nhân bên ngoài khác
• Xin lưu ý rằng các khóa học này chỉ miễn phí cho sinh viên đã đăng ký của Đại học Cambridge. Tất cả những người tham gia khác sẽ bị tính phí đăng ký dưới một số hình thức. Phí đăng ký và thông tin chi tiết khác về chính sách tính phí có tại đây
• Thông tin chi tiết về tiêu chí đủ điều kiện có sẵn ở đây

• Khóa học dành cho người mới bắt đầu và không có kinh nghiệm lập trình trước đó

Python, Xử lý dữ liệu

Sau khóa học này, bạn sẽ có thể

• Chỉnh sửa và chạy mã Python
• Viết các chương trình python xử lý tệp tạo đầu ra cho thiết bị đầu cuối và/hoặc các tệp bên ngoài
• Tạo các chương trình python độc lập để xử lý dữ liệu sinh học
• Biết cách phát triển kỹ năng Python sau khóa học

Trong khóa học này, bạn sẽ học cách

• Tạo và sử dụng biến
• Liệt kê các kiểu dữ liệu phổ biến nhất trong Python
• Sử dụng các cấu trúc dữ liệu khác nhau trong Python
• Sử dụng các điều kiện để thực thi khối mã cụ thể
• Sử dụng các vòng lặp để lặp lại khối mã
• Thao tác chuỗi
• Đọc một tệp và ghi vào một tệp trong Python

Thuyết trình, trình diễn và thực hành

Điều này có thể thay đổi phù hợp với lịch trình đào tạo trực tuyến

• Miễn phí cho sinh viên đã đăng ký Đại học Cambridge
• £ 50/ngày cho tất cả nhân viên của Đại học Cambridge, bao gồm các nghiên cứu sinh sau tiến sĩ, khách tạm thời (sinh viên và nhà nghiên cứu) và những người tham gia từ các Tổ chức liên kết. Xin lưu ý rằng các khoản phí này được chúng tôi thu hồi ở cấp Tổ chức
• Người tham gia có trách nhiệm xin phép trước từ trưởng nhóm, quản lý trực tiếp hoặc chủ ngân sách có liên quan để tham gia khóa học. Chúng tôi yêu cầu những người đăng ký chỉ làm như vậy khi có sự đồng ý của bên liên quan vì chi phí sẽ được trả lại cho Trưởng phòng thí nghiệm hoặc Giám sát nhóm của bạn
• £ 50/ngày cho tất cả những người tham gia học tập khác từ các Tổ chức bên ngoài và các tổ chức từ thiện. Các khoản phí này phải được thanh toán khi đăng ký
• £100/ngày cho tất cả những người tham gia trong Ngành. Các khoản phí này phải được thanh toán khi đăng ký
• Thông tin chi tiết về chính sách tính phí có tại đây

2

Một số lần mỗi năm

Chào mừng bạn đến với khóa học "Nhập môn lập trình tin sinh học với Python". Gần đây, các công nghệ giải trình tự mới đã cho phép có những khám phá mới cho Khoa học Đời sống. Tuy nhiên, kỹ năng máy tính trở nên rất cần thiết để xử lý dữ liệu sinh học lớn. Do đó, biết cách xây dựng các chương trình máy tính là điều cần thiết cho Tin sinh học.

Trong khóa học này, bạn sẽ học những kiến ​​thức cơ bản về lập trình để phát triển các chương trình máy tính áp dụng cho Tin sinh học. Bạn cũng sẽ tìm hiểu về cách tạo thuật toán đầu tiên của mình, tạo đường ống bằng ngôn ngữ lập trình Python và phân tích cơ sở dữ liệu sinh học. Python là ngôn ngữ lập trình chính được sử dụng cho các nhà tin sinh học

Khóa học này lý tưởng cho những sinh viên bắt đầu trong lĩnh vực tin sinh học và những người chưa có kiến ​​thức về lập trình trước đây

Bạn có biết rằng trình tự bộ gen của con người nếu được in ra bằng phông chữ văn bản bình thường, sẽ kéo dài 5000 km, tương đương với khoảng cách từ London đến Montreal, Los Angeles đến Panama, Accra đến Cape Town,  Tokyo đến Calcutta

Trình tự tương tự này sẽ lấp đầy khoảng 3000 cuốn sách có kích thước bằng một cuốn sách bình thường

Hiểu và phân tích trình tự này rõ ràng sẽ là một nhiệm vụ to lớn

Nhưng với sự ra đời của các công cụ và cơ sở dữ liệu mạnh mẽ, chúng ta có thể hiểu đơn giản về một số khía cạnh của nó

Trong khóa học giới thiệu này, chúng ta sẽ khám phá các công cụ và thư viện Python khác nhau được sử dụng để phân tích trình tự DNA, RNA và bộ gen

Do đó, nếu bạn quan tâm đến việc phân tích một lượng lớn dữ liệu sinh học hoặc tò mò về trình tự DNA, quá trình tổng hợp protein và cách vắc-xin được thiết kế. Thì khóa học này là dành cho bạn

Cho dù bạn là sinh viên hay nhà nghiên cứu, nhà khoa học dữ liệu hay kỹ sư tin sinh học, nhà sinh học tính toán, khóa học này sẽ là một hướng dẫn hữu ích khi thực hiện tin sinh học trong Python

Chúng ta sẽ khám phá tin sinh học với BioPython, Biotite, Scikit-Bio, BioJulia, v.v.

Dữ liệu ở khắp mọi nơi, dữ liệu sinh học có trong mọi cơ thể sống. Hãy để chúng tôi phân tích nó cho những hiểu biết hữu ích

Chúng ta sẽ học

• cách thực hiện phân tích trình tự với BioPython, Biotite, v.v.

• cách thực hiện căn chỉnh trình tự với mã

• cách tạo các chức năng tùy chỉnh của riêng chúng tôi để phân tích DNA, RNA và Protein

• cách thực hiện một số tin sinh học với Python

• cách phân tích trình tự DNA của Covid 19, MERS và hơn thế nữa

GHI CHÚ. Đây là một khóa học giới thiệu được cấu trúc giống như một tài liệu tham khảo cho bất kỳ ai quan tâm đến việc thực hiện tin sinh học với python

Làm thế nào để học Python cho tin sinh học?

Python có tốt cho tin sinh học không?

Tôi nên học R hay Python cho Tin sinh học?

Khóa học nào là tốt nhất cho tin sinh học?